慶余年的太平別院的秘密是禁忌之門。根據(jù)葉輕眉在給范閑的信中提到的內(nèi)容,太平別院的湖底隱藏著禁忌之門,也是所有秘密的最終所在。這個(gè)禁忌之門可能是一個(gè)實(shí)驗(yàn)室,里面可能有現(xiàn)代化的高科技設(shè)備,如手機(jī)、導(dǎo)航、電腦等。葉輕眉在信中警告范閑不要打開這扇門,因?yàn)樗赡軙?huì)顛覆秩序。具體的秘密內(nèi)容尚不清楚,但這個(gè)秘密的存在對故事情節(jié)起到了推動(dòng)和重要的作用,引發(fā)了一系列的事件和揭秘過程。慶帝也派兵把守太平別院,說明他知道這里與眾不同,但具體的秘密仍然是一個(gè)謎。