慶余年神廟的秘密是,神廟實際上是一個現(xiàn)代的軍事博物館,保存了許多上個文明生產(chǎn)的武器。神廟位于地球的極北之地,是一個極其特殊和充滿神秘的地方。它被密密麻麻的太陽能光板覆蓋,只有在極晝時才能重新啟動。范閑和海棠朵朵進入神廟后,發(fā)現(xiàn)里面是一個現(xiàn)代科技發(fā)達的軍事博物館,他們看到了肖恩所說的蝌蚪文,通過字體的排列和布局,推測這些字的意思是軍事博物館。神廟還隱藏著人類文明的種子,存儲了上一個世界從新生到滅亡的全過程,旨在讓這個世界避免重蹈覆轍。葉輕眉是少數(shù)幾個知道神廟秘密的人之一,她的仆人五竹是廟里的機器人。掌握了神廟的秘密,就相當(dāng)于掌握了統(tǒng)治慶國的壓倒性實力。所以,慶余年神廟的秘密是它是一個軍事博物館,保存了上個文明生產(chǎn)的武器,并且隱藏著人類文明的種子。