慶余年太平別院湖底的秘密是禁忌之門(mén)。太平別院湖底存在著禁忌之門(mén),可能是一個(gè)實(shí)驗(yàn)室,里面可能有現(xiàn)代化的高科技設(shè)備,如手機(jī)、導(dǎo)航、電腦等。禁忌之門(mén)涉及到人類的生老病死,具體的秘密內(nèi)容沒(méi)有提及。葉輕眉在給范閑的信中提到了湖底的秘密,這個(gè)秘密是一切秘密的最終所在。太平別院是葉輕眉長(zhǎng)期居住的地方,也是慶帝、陳萍萍、范建等人年輕時(shí)的回憶之地。禁忌之門(mén)可能與葉輕眉的實(shí)驗(yàn)、種子的真相以及范閑如何來(lái)到這個(gè)世界有關(guān)。然而,具體的秘密內(nèi)容沒(méi)有提及,所以無(wú)法確定太平別院湖底的秘密是什么。