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基因末世小人物

第三章 四不像的樣品標本

基因末世小人物 冷寂筻 1457 2020-03-18 12:51:18

  第二天,我是被提拉到的6樓。對雖然我看著有點瘦,但是身高在那里呀,大胡子就直接提這我的領(lǐng)子就提上了樓,單手。哎~有點嚴重打擊到我,我需要去健身一下嗎?然后我還被吼了……

  “叫你來幫我做實驗,等了一個早上都不見你。你在3樓貓著,干嘛!“

  “我一直在3樓等你做試驗呀~”理直氣壯的吼回去,我的實驗室在3樓,我當然在3樓等著。

  “昨天和你說了實驗室在6樓,6樓,6樓……”大胡子看來沒有什么耐心。

  “你只是說藥物和你做實驗,沒有說在哪里,昨天你和路桑榆相親相愛來著,沒有說?!贝蠛影櫭迹淮罾砦摇?p>  “開始實驗!”嘆息。

  “好”。

  大胡子丟給我一個活體樣本,然后說:“先做一個全基因組重測序測試,然后結(jié)果盡快給我?!?p>  “目前已知的基因組序列的物種我的電腦庫存不夠,無法準確對比?!?p>  “不用你現(xiàn)在使用的系統(tǒng),我已經(jīng)給安裝了新的程序和實驗資料權(quán)限,在那邊的新手環(huán)上?!?p>  看著我的新手環(huán),特別高大上,通透果綠漂亮的玉制光澤。立馬戴上打開,N級的瀏覽權(quán)限,比我現(xiàn)在的權(quán)限高了3個檔,挖~太給力了。立馬制訂我的實驗方案。全基因組重測序是通過對已知進行不同個體的基因組重測序和序列比對,可以找到大量的SNP(Single Nucleotide Polymorphism)、InDel(Insertion/Deletion)、CNV(Copy Number Variation)等信息,從而進行個體或群體的基因組的差異性分析,在植物育種研究、遺傳進化分析及重要性狀候選基因預測方面,具有重要的科研和產(chǎn)業(yè)價值。

  全基因組重測序我做過很多回了,這次也是駕輕就熟的。制定好方案和排列好設備后就是樣品提取了,雖然現(xiàn)在科技發(fā)達,大部分的基礎材料已經(jīng)可以由試驗機器人做,但是原始的提取工作卻還是手工的成功率大很多。基因是個有趣的東西,它對自己的性格并不比對環(huán)境擁有更大的決定權(quán)?!昂芸赡苓@顆星球上的一切夢想,都是由于生命本身的密碼“,基因無法破譯生命的密碼,而基因密碼卻預先規(guī)定了它對各種事情的反應方式。

  拿著我手里四不像的樣品標本,我不懂這是什么生物。這是一個半軟體半硬體類圓形物體,邊緣像經(jīng)過精細加工一樣十分的光滑,大小大約只有5公分;硬體有點像威尼斯共和國送給佛朗索瓦一世的那些美麗貝殼,巴黎圣修佩斯教堂有兩個巨大的圣水池就是用那種貝殼做的,在陽光下閃閃發(fā)光,美麗非常。

  先用高倍顯微鏡觀察了一下它。軟體部分的樣子非常奇異,一團黏肉上有許許多多的觸手,觸手上有吸盤,觸手晃蕩的樣子有點像海里珊瑚觸手,外形像笛子一般,只等著海神波塞冬來吹。

  硬體貝殼在顯微鏡下有一層層花朵般的圖騰,花形也不是隨意排列,是組成了五色斑斕的圖案卻又集聚幾何色彩,顯微鏡探頭再往深處去,硬體具有層次變化,一層比上面的一層有更多的幾何圖案,而且圖案越來越復雜,只是顏色黯淡了些。大胡子和我說過不允許我切片實驗,這就給我出了難題,軟體部分還好,看起來就是統(tǒng)一的物質(zhì),形態(tài)也統(tǒng)一。硬體這么細密的層次,和不是特別明顯可確認的同一物質(zhì)的特征,讓我對我的實驗方案不得不進行調(diào)整。

  我先對軟體進行樣品基因組的提取,提取樣為DNA=5μg OD260/280為1.8-2.0,30×基因組大小的測序深度,這是初測,如果結(jié)果的基因組復雜程度較高或SNP準確率不理想的話,再適當加深測序深度。文庫構(gòu)建——上機測序——原始測序數(shù)據(jù)——數(shù)據(jù)質(zhì)控——數(shù)據(jù)分析,一套流程下來也不是一天二天可以完成的。反正大胡子沒有規(guī)定我時間,我決定慢慢來。

  哈哈~不過我對這四不像的樣品標本很好奇,它不像星球上有的東西,而且硬體部分上的圖案讓我有點莫名的煩躁和熟悉,我難得對一個什么東西感興趣,好奇害死貓的事情在我身上出現(xiàn)比較少,因為懶~不再多想,下班,今天要去市區(qū)耍耍。像這樣偏僻的實驗室呆久了,是會傻的,為了不讓自己早日癡呆,定期我都會出去放松一下。

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