當細菌劃線接種到固定平板培養(yǎng)基上后，在適宜的培養(yǎng)條件下。細菌便迅速生長繁殖。由于細菌細胞受固體培養(yǎng)基表面或深層的限制，故不能在液體培養(yǎng)基中那樣自由打散，因此繁殖的菌體集落，通常稱之為菌落(Colong)。由于平板劃線的分散作用，單個菌落來源于細菌的一個細胞，生長一定時間后便肉眼可見，挑選一個菌落移種另一固體斜面培養(yǎng)基上，即可獲得細菌的純培養(yǎng)。
各種細菌在一定條件下形成的菌落的大小，形狀，光澤，顏色，硬度，透明程度等。所以細菌菌落特征是細菌的細胞結(jié)構(gòu)與生長行為，如細菌的夾饃，它的存在與否和菌落形態(tài)等有直接關(guān)系，肺炎鏈球菌因具有夾饃就形成光滑型菌落，其表面光滑黏稠，不具夾饃的菌株形成的菌落為粗糙型，菌落表面干燥，有皺折，表明菌落特征和細菌細胞的結(jié)構(gòu)密切相關(guān)。
菌落的形狀和大小不僅決定于菌落中細胞的特征，而且也受到周圍菌落的影響，菌落靠得太近，由于營養(yǎng)物質(zhì)有限，有害代謝物的分泌和積累，因而生長受到抑制。所以在平板分離菌種時，?？煽吹狡桨迳匣ハ嗫拷木涠驾^小，而那些分散開的菌落均較大。即使在同一菌落中，由于各個菌落中，細胞細胞所處的空間位置不同，在營養(yǎng)的攝取及空氣供應(yīng)等方面亦都不一樣，所以在生理上，形態(tài)上或多或少會有所差異。
在平板培養(yǎng)基上形成的菌落往往有三種情況，即表面菌落，深層菌落和底層菌落，上面所介紹的菌落特征都是指表面菌落。某些菌落在膠培養(yǎng)基中生長繁殖時，能產(chǎn)生明膠酶水解明膠。如果將這些菌種穿刺接種在盛有明膠養(yǎng)基的試管中，則由于明膠被水解形成不同形狀的溶解區(qū)，由于特定的細菌形成一定形狀的溶解區(qū)，所以是細菌分類的項目之一。
繁殖
細菌是非常微小又原始的生物，所以它們的繁殖方式及在培養(yǎng)基上的生長情況與高等動植物細胞有較大的差異。
古細菌
古細菌(archaeobacteria)(又可叫做古細菌或者古菌)是一類特殊的細菌，多生活在極端的生態(tài)環(huán)境中，具有原核生物的某些特征，如無核膜及內(nèi)膜系統(tǒng)；也有真核生物的特征，如以甲硫酸起始蛋白質(zhì)的合成，核糖體對氯霉素不敏感，RNA聚合酶和真核細胞的相似，DNA具有內(nèi)含子并結(jié)合組蛋白；此外還具有既不同于原核細胞也不同真核細胞的特征，如：細胞膜中脂類是不可皂化的；細胞壁不含肽聚糖，有的以蛋白質(zhì)為主，有的含雜多糖，有的類似于肽聚糖，但都不含胞壁酸，D型氨基酸和二氨庚二酸。
區(qū)別
于病毒的區(qū)別
細菌和病毒同屬于微生物，只有在顯微鏡下才能看到。但兩者是截然不同的東西。
病毒是一類個體微小，無完整細胞結(jié)構(gòu)，由蛋白質(zhì)和核酸組成，必須在活細胞內(nèi)寄生并復(fù)制的非細胞型微生物。