在這個神奇寶貝的世界里，神奇寶貝和人類和平的生存著，在這之中，得到了神奇寶貝認(rèn)可的人，可以把神奇寶貝裝入到一個他們稱作“寶貝球”的物件里，和人類一起成長。而這樣的人就被稱作“訓(xùn)練家”，而神奇寶貝又被叫做寵物小精靈，故此我們就統(tǒng)一把神奇寶貝叫做精靈。我們的故事就要從這里開始。

　　某一天，位于關(guān)東地區(qū)的真新鎮(zhèn)的大木博士正在野外考察神奇寶貝的生存習(xí)慣和環(huán)境。突然，一只棕色的精靈向大木博士跑來，不停的叫著“布咿，布咿”，沒錯，來的正是一只伊布。

　　大木博士看見伊布跑來，又跑開的樣子，知道是要他跟過去，于是就連忙跟著伊布走了過去，在穿過一片草原過后，大木博士來到了一條河流邊，見到了被水精靈看護(hù)著的一個包裹，打開一看，竟然是一個剛出生不久的嬰兒，看樣子已經(jīng)被丟棄在這里有一段時間了。

　　伊布見到大木博士發(fā)呆的樣子，連忙叫了幾聲，驚醒了沉思中的博士。大木博士連忙抱起小孩子，見到包裹中還有一顆水晶一樣的石頭，里面有著兩道糾纏在一起的花紋，旁邊還有一條項鏈一樣的裝飾。博士拿起石頭，抱著嬰兒，連忙向自家的研究所走去。

　　在回到研究所后，大木博士連忙請鎮(zhèn)上的花子來幫忙，等到花子來到之后，半開玩笑的對大木博士說道：“這該不會是您的私生子吧！”大木博士沒好氣的說道：“這是我在外面河邊撿到的，不知道是誰把他扔到了這里，所以就麻煩你來照顧了。”

　　就這樣，大概三年之后，大木博士仍舊進(jìn)行著他的研究，與之前不同的是，研究所里多了一個成員。

　　“小然，你在嗎？快點出來咯！要開飯了！”外面?zhèn)鱽砹嘶ㄗ拥慕新暎茄芯克锏哪堑佬⌒〉纳碛安⑽匆苿印?p>　　等到花子進(jìn)來的時候，只是見到一道小小的身影正在和一群精靈玩耍，嘴里的笑聲就沒有停下來過。

　　突然，一雙手抱起了這個身影，耳邊傳來溫柔的聲音：“該吃飯了，小調(diào)皮?！鄙碛耙宦牐B忙停下掙扎的動作，脆生生的說道：“我知道了，花子阿姨?！?p>　　原本這樣的時光應(yīng)該繼續(xù)這樣持續(xù)下去的，但是今天卻發(fā)生了一件意外的事：研究所中傳來了一陣吵鬧的聲音，“怎么回事，小然怎么不見了！”花子阿姨焦急的說道，“博士，你怎么連一個小孩子也看不住??！”大木博士在一邊不好意思的臉紅了。

　　在經(jīng)過了一陣翻天覆地的尋找過后，終于在研究所后山的一個山洞里找到了小然，大木博士連忙抱起小然往研究所走去，絲毫沒有注意到一旁角落里的小小的身影。而此時的小然正在昏睡著，夢里多出來許多記憶，與這個世界不相干的記憶。

　　在長達(dá)一天的昏睡后，小然醒了過來，發(fā)現(xiàn)守在自己床前的是一只灰褐色的身影，仔細(xì)一看，原來是一只伊布。伊布見到小然醒來，歡喜的叫道“布咿！布咿！”這驚動了在外面的博士和花子阿姨。

　　在經(jīng)過小然仔細(xì)的講述了自己的經(jīng)歷后（隱瞞了腦海里多出的記憶），大木博士終于放心了，并說明了是這只伊布發(fā)現(xiàn)的小然，也就有了先前的一幕。

　　見到伊布十分喜歡小然，大木博士也就同意了由小然撫養(yǎng)這只伊布（雖然我并不認(rèn)為小然可以養(yǎng)活這只伊布，因為他自己都還沒辦法養(yǎng)活自己）。

　　而在這之后，大木博士也發(fā)現(xiàn)，似乎所有的精靈都很親近小然，很愿意和小然相處，這讓大木博士有些好奇小然的身份。

　　而小然則一點也沒有在意到這些，每天就是逗弄著伊布，和研究所里的精靈一起玩耍。

　　小然傳奇的旅途中的第一個伙伴已經(jīng)現(xiàn)身了，你知道它是誰嗎？而在山洞里的那個身影又會是誰呢？