隨著馬士英、劉良佐的覆滅，以及江北四鎮(zhèn)其他三名總兵高杰等人的臣服，江北四鎮(zhèn)徹底偃旗息鼓，短時間內(nèi)毫無對抗朝廷之意。
見到這種情況，明朝江南數(shù)省的軍政大員們，也全部安定下來了。
以馬士英鳳陽總督的身份和手握數(shù)萬重兵的實力，都被朝廷翻手間給剿滅了。其他總兵、指揮使什么的，還是安穩(wěn)點，不要再挑戰(zhàn)崇禎皇帝和朝廷的權(quán)威了。
隨后數(shù)月，江南數(shù)省布政使征收押解到南京的稅銀開始增多；各省都指揮使、重鎮(zhèn)的總兵等高級軍官也紛紛上書朝廷，表達(dá)了對朝廷的耿耿忠心。
不僅如此，大家還紛紛開始在南京朝廷拉攏關(guān)系，討好崇禎皇帝的親信大臣。楊毅的親信王承恩、史可法、劉源濟、宋應(yīng)星等人紛紛受到熱捧，成為江南地方軍政高官拉攏的對象。
看來，楊毅當(dāng)機立斷，以迅雷不及掩耳之勢鏟除馬士英的做法，還是取得了很大的成效的。這次成功的平叛軍事行動，終于讓江南數(shù)省的文武百官們認(rèn)識到：崇禎帝即使打了敗仗，丟了北方大片領(lǐng)土，他也還是皇帝。
天子一怒、伏尸百萬，崇禎帝一聲令下，仍然有無數(shù)文官武將為他效力。要跟崇禎皇帝、跟朝廷對著干，永遠(yuǎn)都沒有好處。
既然不想對著干，那就要主動靠攏啦。因此，王承恩這些崇禎帝的親信大臣，就成了大家巴結(jié)和拉攏的對象了。
這是楊毅樂意見到的，來到明末四五個月后，終于是借著馬士英的人頭將威望豎立起來，不再是天下人眼中的流亡皇帝了。
只有到現(xiàn)在這樣，他這個冒牌崇禎皇帝的命令，才能得到江南所有文武官員的擁護(hù)和執(zhí)行。才談得上進(jìn)行各種改革，重整旗鼓，北伐中原。
大理寺在審理劉良佐等人叛亂案的時候，已經(jīng)養(yǎng)好身體的刑部尚書張慎言覲見了崇禎皇帝。楊毅對他在鳳陽遭受的委屈安撫了一番后，詢問他對今后工作的想法。
其實這就是在考驗張慎言的選擇了。
如果他流露出懼怕，畏縮不前的心理，楊毅自然不會勉強他再去四處查案。但是，他刑部尚書的官帽子，恐怕也得換一個人來戴了。
張慎言自然不是蠢人，明白皇上話語中的考驗味道，很是堅定地表達(dá)了他緊跟皇上的思維路線、繼續(xù)嚴(yán)厲懲辦違法官商的決心。
根據(jù)楊毅獲得的情報，張慎言在被馬士英關(guān)押、百般折磨的時候，始終不曾向馬士英低頭?，F(xiàn)在再看到他不畏艱難，想要繼續(xù)外出查案，懲辦違法官商的決心，不由龍顏大悅。
既然張慎言不怕危險，要繼續(xù)查下去，楊毅也沒必要如前任朱由檢那么瞎折騰，胡亂撤換大臣了。
如此，張慎言繼續(xù)擔(dān)任他的專案組組長，查辦江南數(shù)省糧價暴漲案的不法商人和相關(guān)違法官員。刑部專案組成員四處出擊，逮捕已經(jīng)被其他案犯供出來的江南糧價暴漲案的相關(guān)案犯。
馬士英叛亂案的前因后果已經(jīng)傳了出去，大家都知道最初就是因為劉良佐倒賣軍糧，張慎言前去逮捕他，結(jié)果卻被馬士英扣押引起的。
隨后發(fā)生的事，就天下皆知了。
皇上派兵部尚書為史可法，去跟馬士英交涉。馬士英卻擁兵自重，拒不釋放張慎言，還提出了許多苛刻的條件，惹怒了史可法。
于是，史可法聯(lián)絡(luò)了鳳陽駐軍中諸多忠君愛國的將領(lǐng)，于六月二十四日凌晨進(jìn)入鳳陽府城，包圍突襲了鳳陽總督府，將馬士英當(dāng)場斬殺，劉良佐也被俘虜捆到南京進(jìn)行審判。
可以說，馬士英叛亂被殺，起因就是受了劉良佐倒賣軍糧的拖累。
如果不是劉良佐違法亂紀(jì)在前，朝廷也不會派刑部尚書去逮捕他。朝廷不逮捕他，馬士英也不會為了保他而跟朝廷翻臉，最后被史可法當(dāng)反賊給剿滅了。
如此，受到馬士英、劉良佐一案的影響，江南數(shù)省官府和軍隊都不再敢跟專案組打馬虎眼，拖延推諉了。無論涉及到誰，什么背景，他們都馬上將此人停職，交給專案組處理。
七月末，安慶知府阮大鋮被押解到南京，關(guān)入大理寺天牢；八月初，福王朱由崧被錦衣衛(wèi)逮捕，帶回了南京；同時被解職的還有淮安知府、揚州知府。
他們雖然沒收受大額的賄賂，卻在福王朱由崧的游說下，對淮安和揚州府不法糧商非正常漲價的事視而不見，要負(fù)一定的責(zé)任。
福王朱由崧被押解到南京后，以他的身份，卻是不適宜關(guān)入大理寺天牢了。楊毅下旨，在皇宮邊上找了一棟被查抄的官員府邸，將朱由崧安置了進(jìn)去，進(jìn)行監(jiān)視軟禁。
除了錢謙禮、阮大鋮、劉良佐、朱由崧等主要案犯外，其他江南各省趁中原局勢混亂，跟著錢謙禮等人囤積居奇、大發(fā)國難財?shù)募Z商和官員也被抓了起來，等待律法的嚴(yán)懲。
除了這些直接犯罪的官員和商人外，其他對此事應(yīng)對不力的地方官府主事人，也被朝廷問責(zé)，拿下了不少人，貶謫到閑職上提前養(yǎng)老去了。
連應(yīng)天府尹凌義渠也被問責(zé)，在吏部留下了一個“瀆職失察、應(yīng)對失措”的評語。短時間，凌義渠是不用想再得到提升了。
劉良佐、阮大鋮這些人，自然逃不過律法的嚴(yán)懲。而朱由崧，因為他的身份，被崇禎帝下旨特赦，饒過了他的性命。但是，他福王的封號卻被剝奪，一切封地福利全部收回，今后朱由崧就要以一個普通老百姓的身份在南京生活了。
對這一點，朱由崧自然是不無怨言的。
一個從小到大好吃懶做的小王子，繼承福王王位后也是養(yǎng)尊處優(yōu)的，四體不勤、五谷不分?，F(xiàn)在一步踏錯，被皇上剝奪了他的一切封號和福利，讓他自己找活路，還不許離開南京，這不是為難人么？
但是，再為難也無法反對啊。自己參與不法糧商囤積居奇、大發(fā)橫財，乃是鐵證如山，推也推不掉的?；噬蠜]有砍了自己的腦袋，還是看在自己父親老福王朱常洵曾經(jīng)為國捐軀的份上。
現(xiàn)在看來，自己是要用一頂福王的帽子，換回自己的小命了。
于是，曾經(jīng)的福王朱由崧,就只能在南京城里開始到處找事做,掙錢糊口了。而這些行動，還是在錦衣衛(wèi)的監(jiān)督監(jiān)視之下的。朱由崧卻也無可奈何，誰叫自己牽扯進(jìn)了這么大的案子中。
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