光和七年九月，徐州刺史巴衹及從事趙昱討平瑯玡、東海、彭城、下邳、廣陵五郡黃巾。破虜校尉鄒靖破廣陽黃巾。徐、幽二州乃定。
十月，皇甫嵩久攻廣宗不克，于是退而結(jié)營。待黃巾麻痹，突然夜襲廣宗，斬人公將軍張梁，獲級三萬。待官軍入城，方知天公將軍張角已于八月病逝。于是，皇甫嵩命人剖棺戮尸，又將張角首級傳送京師。
此后，皇甫嵩又會同鉅鹿太守郭典，馬不停蹄，直奔下曲陽。至十一月，斬地公將軍張寶，獲級十萬?；矢︶杂谑敲擞诔悄现┯^，一時間下曲陽浮尸遍地，血流成河。至此，冀州升平。
冀州乃定，信都縣令閻忠進(jìn)言皇甫嵩曰：將軍威震天下，風(fēng)馳四海。然昏主之下，難以久居，如不早圖，恐后悔無及?；矢︶詰衷唬嘿硪乖诠?，心不忘忠。非常之謀，反常之論，所不敢聞。閻忠見皇甫嵩不聽勸諫，棄官逃亡。
待張角首級及冀州平定的消息先后傳至京師，天子劉宏興奮不已，一道中旨拜皇甫嵩為左車騎將軍，領(lǐng)冀州牧，晉封槐里侯，食槐里、美陽兩縣共八千戶。
再說荊州宛城，朱儁調(diào)虎離山，以徐璆、秦頡佯攻城南。自己則暗渡陳倉，親率五千精兵從城北以土坡突入城中。黃巾不敵只得退守內(nèi)城。
渠帥韓忠惶懼官軍威勢，遣人乞降。副將張超及徐璆、秦頡皆欲聽之。誰知朱儁卻拒不受降，道：兵有形同而勢異者。昔秦、項(xiàng)之際，民無定主，故賞附以勸來耳。今海內(nèi)一統(tǒng)，唯黃巾造寇，納降無以勸善，討之足以懲惡。今若受之，更開逆意，賊利則進(jìn)戰(zhàn)，鈍則乞降，縱敵長寇，非良計(jì)也。于是下令急攻，然連戰(zhàn)不克。
一日朱儁登高遠(yuǎn)眺，突然計(jì)上心頭，令城北解圍。圍三闕一之下那韓忠果然中計(jì)，引軍突圍。朱儁趁勢追擊，大破其軍，斬首萬余，韓忠亦為秦頡所殺。
韓忠既死，宛城黃巾又推孫夏為帥，仍據(jù)守宛城。于是朱儁以孫堅(jiān)為先登復(fù)攻宛城。那孫堅(jiān)英勇善戰(zhàn)，身先士卒，猶如天神下凡，所向披靡，加之從者前赴后繼，黃巾大敗。孫夏棄城而走，至西鄂精山，為追兵斬殺，又獲級萬余，余賊潰逃。那孫堅(jiān)又領(lǐng)著朱治、程普一路追擊至鄧縣，雙方一場大戰(zhàn)，全殲黃巾余孽，荊州乃定。
荊州黃巾的覆滅，意味著這場歷時不到一年，卻席卷全國七州，聲勢浩大的叛亂終以落敗收場。
十二月，天子大赦天下，改元中平。詔減太官珍饈，御食一肉；廄馬非郊祭之用，悉出給軍。并封賞黃巾之亂中先策及有功之臣。
拜朱儁為右車騎將軍，封錢塘侯，食邑五千戶，加位特進(jìn)。（特進(jìn)為加官，無實(shí)職，朝會時位列三公之下）
前任太尉楊賜因先策有功，拜尚書令。楊賜拒不受官。于是又封其為臨晉侯，以特進(jìn)回府。
封孫堅(jiān)為別部司馬。
護(hù)軍司馬傅燮居功至偉，卻因與中常侍趙忠有隙，受其構(gòu)陷。劉宏雖知傅燮為人，不加其罪，卻也僅封了個安定都尉。
至于其他州、郡平亂有功者具有金銀賞賜或記軍功薄。
而此前下獄的盧植因逢大赦，又得皇甫嵩上書陳情，官復(fù)尚書原職。董卓亦為朝廷所赦。
有人加官晉爵，自然有人激流勇退。徐州從事趙昱因不滿朝廷將首功論于刺史巴祇，憤而辭官。
至于豫州刺史王允，先前謀誅十常侍不成。張讓于是懷恨在心構(gòu)陷其下獄。后雖逢大赦，旬日后又被張讓尋了由頭再度下獄。最終，得臨晉侯楊賜、大將軍何進(jìn)、司徒袁隗聯(lián)名上疏陳情，這才免了死罪，隱居鄉(xiāng)里。
可正當(dāng)朝堂之上意興盎然，四海之內(nèi)升平人瑞之時。此前未受黃巾波及的涼州卻又生出事端來。
說起來，那涼州原本只是來自北地、安定及來自金城、隴西的兩支羌人聚眾作亂。消息傳到朝廷，朝廷卻未及重視。一來，涼州歷來胡漢雜居，其中羌人又時常叛亂，朝廷早就習(xí)以為常。二來，天下方定，國庫空虛，朝廷也無暇西顧。于是詔令州郡自行平亂。然而小洞不補(bǔ)大洞吃苦，任誰也不會想到，此后十?dāng)?shù)年間，東漢朝廷將完全丟失對于涼州的掌控。
令居縣外，一支漢軍旗幟的軍隊(duì)正在此處駐扎，領(lǐng)軍的乃是護(hù)羌校尉冷征。數(shù)日前，他得了朝廷詔令，命他領(lǐng)本部兵馬及湟中義從討伐四郡叛羌。今日早些時候，他匯了湟中義從，便行軍往金城方向。待到令居，已近入夜，于是下令安營扎寨。此時，他正在中軍大營中研看地圖。忽聞帳外傳來一陣騷亂，于是問道：“帳外何事喧嘩？”
恰有守營衛(wèi)士入帳匯報(bào)，道：“稟校尉，軍中有人斗毆?！?p> “走，去瞧瞧！”冷征二話不說，提起馬鞭，便走出營帳，卻看到一群士兵正扭打在一起。冷征當(dāng)即怒道：“都給某住手！”
誰想，那群士兵早就殺紅了眼，那里還聽得進(jìn)他說話。冷征于是對左右喊道：“來人，給我拿下。”便有兩隊(duì)士兵披甲執(zhí)戟魚貫而來，只片刻，便平息了騷亂。冷征這才看清眼前涇渭分明的兩伙人，一伙是自己麾下官軍，而一伙便是湟中義從中的胡人。
冷征本中原人士，對這涼州苦寒向來頗有微詞，又為人倨傲，瞧不上取木為兵的羌胡。此時自然不會刨根問底，只冷冷道：“軍營之中，聚眾斗毆，爾等眼中，可有本校尉？來人，將這群胡人拖下去，軍法伺候?！?p> 卻聽到羌人中一人喊道：“將軍，我等不服，是他們先動的手，何故只罰我等！”
那冷征冷笑一聲，上前幾步，便賞了那人一頓馬鞭，一邊道：“何故？爾等區(qū)區(qū)胡狗，也敢問我何故？”說罷，他手中又加重力道。卻聞身后傳來一句“住手?！?p> 冷征回頭一看，卻見幾人匆匆而來，為首一人，正是湟中義從軍侯北宮伯玉。那北宮伯玉雖為漢人，然北宮家世居金城，又親善羌胡，于羌人中威望甚高。但在冷征眼中卻是與那般胡狗無異。于是道：“軍侯意欲何為？”
北宮伯玉本也不怎待見冷征，奈何自己這湟中義從軍侯之職卻是受其節(jié)制，此時人在屋檐下，卻是不得不低頭，于是恭順道：“稟校尉，此間之事，吾已有耳聞，乃因肉食之事，起了爭執(zhí)，這才動手腳來。本非什么大事，何必大動干戈，不如大事化小，以免影響士氣?！?p> 官軍每頓皆有肉食，胡兵只得粟米，這正是他冷征安排，他自然心中有數(shù)。只見他輕蔑的瞥了北宮伯玉一眼，不屑道：“笑話，區(qū)區(qū)胡狗也配與我漢家兒郎相提并論，在某看來，便是粟米，也是浪費(fèi)了?！?p> 便是泥菩薩也有三分火氣，莫說北宮伯玉自小生長西北苦寒。見冷征這般神情，言語之中又多有侮辱，他當(dāng)下也是怒急，正色道：“在吾看來，此間只有大漢雄師，卻無漢胡之分。大人出言輕慢，厚此薄彼，是非不分。難道這便是中原文教，官軍氣度？”
冷征見他出言相譏，卻是使出慣用伎倆道：“輕慢？便讓你曉得何為輕慢，軍司馬何在？”
那軍司馬卻不知何時來的，從旁邊出列道：“屬下在?！?p> 冷征道：“軍營之中，沖撞主將，依軍法該當(dāng)如何？”
軍司馬素知北宮伯玉名聲，此時顯得左右為難，道“稟校尉，依軍法該，該......”
冷征見其說話吞吐，顯出些許怒意，堅(jiān)定追問：“說！該當(dāng)如何？”
那軍司馬朝北宮伯玉瞧了一眼，露出歉意神色，回道：“依軍法，沖撞主帥，鞭三十，以儆效尤?！?p> 冷征聽罷，卻對左右道：“將北宮伯玉及一眾胡狗拖下去，鞭六十。”
鞭六十非同兒戲，便是不死，也得重傷，北宮伯玉此時雖已被兩名士兵按住肩頭，卻掙扎喊道：“冷征，你濫用私刑，某定不輕饒你?！?p> 眼看北宮伯玉被越拖越遠(yuǎn)，同為湟中義從軍侯的李文侯開口道：“校尉，臨陣施罰，恐損士氣，不如...”他話未說完，卻被冷征打斷道：“汝欲連坐否？”
光和七年十一月，護(hù)羌校尉冷征輕慢兵士，濫用私刑，致湟中義從兵變。叛軍斬冷征于令居，又匯合四郡叛羌，一路攻城略地，短短數(shù)周便攻占金城郡治允吾。金城太守陳懿出面安撫，卻為叛軍所害。
叛軍又脅迫新安縣令邊允、涼州從事韓約入伙，并舉邊允為帥。后因朝廷通緝，邊、韓二人分別改名邊章、韓遂。
十二月，邊章率叛軍進(jìn)擊漢陽，圍涼州刺史左昌于冀縣。幸得漢陽太守蓋勛來援，又因那邊章、韓遂素敬蓋勛為人，哭泣而去，這才解了冀縣之圍。
然而，涼州，已亂。